航空工程技术研究院成立于2016年，是滨州学院校属院管科研机构，围绕航空强国、制造强国强省战略需求，坚持学校“顶天（对接航空产业）立地（对接区域）”的发展思路，以航空工程、机械工程和材料工程为学科优势，积极布局飞行器设计与制造、航空结构件先进制造、表面工程和高性能金属材料等科研领域，在相关方向取得丰富的科研成果并积极对接行业开展成果转化应用。
研究院下设飞行器制造技术研究所和摩擦磨损研究所2个院属院管科研机构。主要开展航空结构件先进制造、薄壁件高精度加工、结构摩擦磨损等方向的科学研究。依托山东省高等学校航空结构件先进制造重点实验室、滨州市航空结构件表面工程重点实验室、滨州市机电工程重点实验室等科研创新平台开展科学研究。组建了航空结构件表面工程、微纳制造、材料加工成型、高效加工及装备4个科研创新团队。